Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FOXD4Q12950 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FOXD4Q12950 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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