Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAF2Q12933 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms