Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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