Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TROQ12816 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TROQ12816 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TROQ12816 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TROQ12816 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TROQ12816 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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