Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNA1Q09470 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms