Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FAM27E3Q08E93 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms