Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSME1Q06323 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms