Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN12Q05209 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms