Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSBP1Q04837 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms