Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACVR1Q04771 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACVR1Q04771 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms