Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSG1Q02413 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms