Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAP1Q01518 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms