Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTBN1Q01082 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTBN1Q01082 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms