Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ACTBP60709 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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