Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1P60507 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms