Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLDN15P56746 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLDN15P56746 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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