Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC13P55735 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms