Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM5CP41229 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms