Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GGCXP38435 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GGCXP38435 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms