Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms