Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms