Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms