Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXA6P31267 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXA6P31267 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXA6P31267 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms