Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA1P29973 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms