Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms