Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD10P28358 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms