Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKBIAP25963 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKBIAP25963 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms