Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDHBP21953 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDHBP21953 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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