Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYT1P21579 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms