Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMNB1P20700 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms