Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6P18850 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6P18850 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6P18850 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6P18850 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6P18850 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6P18850 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6P18850 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATF6P18850 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms