Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms