Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms