Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
COL6A2P12110 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms