Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGB3P05106 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms