Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1P04632 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms