Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OTCP00480 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OTCP00480 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OTCP00480 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OTCP00480 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms