Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms