Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIN3BO75182 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms