Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNC1O60486 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms