Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXA2O43364 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms