Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms