Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

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Length 1,565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNMO15061 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNMO15061 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNMO15061 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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