Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PTPRTO14522 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PTPRTO14522 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PTPRTO14522 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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PTPRTO14522 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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PTPRTO14522 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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