Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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