Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8SH3BPF8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms