Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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USP17L12C9JPN9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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