Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRT4C9JH25 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms