Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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