Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPIPB15A6NHN6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms